Viện KHCN& QL Môi Trường có các chức năng đào tạo như sau:

• Đào tạo bậc Đại học và sau Đại học các chuyên ngành Công nghệ môi trường, Quản lý môi trường và Tài nguyên môi trường.
• Đào tạo bậc Cao đẳng  chuyên ngành Công nghệ môi trường và Quản lý môi trường.
• Đào tạo bậc Trung cấp chuyên ngành Công nghệ môi trường, Kỹ thuật Môi trường và thực hiện các khóa đào tạo ngắn hạn, bồi dưỡng kiến thức chuyên môn thuộc lĩnh vực bảo vệ môi trường.
• Hợp tác quốc tế trong nghiên cứu chuyển giao KHCN và đào tạo trong lĩnh vực KHKT và môi trường.